题 目：RNA-Seq测序的方法与应用

报告人：张学工 教授（清华大学自动化系）

时 间：5月9日　 下午 3:30-4:30

地 点：中科院植物所图书资料馆报告厅

联系人：景海春 (hcjing@ibcas.ac.cn　 62836576 )

报告人简历：

张学工教授1989年毕业于清华大学自动化系, 1994年获清华大学模式识别博士学位后留校工作，2001、2006年任哈佛大学高级访问学者。现任清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学部主任，2006年获国家杰出青年基金，973项目“基于新一代测序的生物信息学理论与方法”首席科学家。主要研究方向为模式识别与机器学习、高通量生物数据分析、基因表达和调控、选择性剪接与RNA调控等。

主要参考文献：

1.王曦等，新一代高通量RNA测序数据的处理与分析，《生物化学与生物物理进展》，2010, 37: 834-846.

2.Wu Z, et al. Using non-uniform read distribution models to improve isoform expression inference in RNA-Seq. Bioinformatics. 2011, 27:502-8.

3.Wang X, et al. Isoform abundance inference provides a more accurate estimation of gene expression levels in RNA-seq. JBCB, 2010, 8:177-92.

4.Wang L, et al. DEGseq: an R package for identifying differentially expressed genes from RNA-seq data. Bioinformatics. 2010, 26:136-8.

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